16S rDNA Sequencing NGS Service

實驗流程

樣品條件

DNA QC 標準：
Sample Type	Genomic DNA (RNase Treat & Dissolved in Nuclease-free Water)
Amount	≧ 5 μg
Concentration	≧ 50 ng/μl
OD260/280	1.8-2.0	OD260/230	≧ 1.6
Ration of gDNA Conc.	Qubit / NanoDrop ≧ 0.7

定序策略

1. Illumina Solexa Platform
2. 300 Paired-End / 2Gb 以上的定序量

威健在生物高通量實驗技術服務有相當專業且豐富的經驗。面對 NGS 熱潮，我們皆以客戶需求為優先考量，依照客戶預算與研究需要，經全盤評估後建議最佳定序量或實驗方式。專業而靈活的服務，每個步驟的用心都值得您信賴！

分析流程及內容

Standard Analysis - 標準分析服務

1. Paired-End Merge：連接兩端 reads 來得到完整的 16s Amplicon 序列。
2. Data Cleaning：去除 Quality 較差與嵌合體序列，以確保後續分析的正確性。
3. OTU Clustering：將彼此一致性在 97% 的序列歸類在同一組別。
4. OTU Annotation：對 OTU 代表序列進行註解。
5. Alpha Diversity：物種豐富度評估。
6. Beta Diversity：樣品間物種差異評估。

Advanced Analysis - 進階分析服務 ( 加選 )

1. PCA：反應樣品間差異程度。
2. Heatmap：比較不同樣品間的物種組成。
3. Phylogenetic Tree Analysis：根據 OTU 資訊進行演化樹分析。