microRNA (miRNA) 是一種內生的的單股、非編碼的小片段 RNA,長度約 19-25 個核苷酸,在生物體透過 post-transcriptional 基因沈默的途徑,抑制蛋白質生合成,進而影響細胞發育、增生、分化、凋零等相關蛋白的表現;自 1993 年首度發現 miRNA 至今,Sanger miRBase 資料庫內的 miRNA 數目不斷增加,其中人類 miRNA 已發現有 940 個,且有將近 1/3 的人類基因受 miRNA 調控。
近年有關人類癌症的研究已著重在 miRNA 的調控上,許多文獻指出改變腫瘤基因或腫瘤抑制基因表現的關鍵因素可能是其 miRNA 作用所導致。因此 miRNA 可作為人類疾病預測、分類及癌症治療的生物性指標。
Agilent miRNA 生物微陣列系統於 2007 年 5 月推出,具有高通量分析、高靈敏度、高靈活性、高準確率及相對成本較其餘檢測方式低價等優勢。在晶片上利用獨特的探針設計,使得研究人員無需額外純化 small RNA,可直接以 total RNA 進行實驗,實驗結果經驗證準確率達 75% 以上。
Agilent 系統的穩定性能保障未來技術的延續,並不斷地隨著 Sanger miRBASE 資料庫更新晶片探針的完整度,為學術研究及臨床診療提供最準確的檢測平台。
Agilent 獨特的 miRNA 探針設計
Application
晶片物種 | 序列來源 | 規格 |
---|---|---|
Human | Sanger miRBase v.14.0 887 human miRNAs represented |
8 x 15K |
Mouse | Sanger miRBase v.15.0 696 mouse miRNAs represented |
8 x 15K |
Rat | Sanger miRBase v.15 387 rat miRNAs represented |
8 x 15K |
威健提供客製化 miRNA 晶片,詳情請見客製化晶片服務
2011 年將推出 Sanger miRBase V16
檢體類別:Tissue、Cell line、total RNA
RNA QC 標準: | ||||
---|---|---|---|---|
RNA amount | RNA concentration | OD260/280 | 28S/18S Ratio | RIN |
0.5 µg | ≧ 50 ng/ µl | ≧ 1.8 | ≧ 1.2 | ≧ 7 |
|
流程說明 | ||
---|---|---|
以 NanoDrop 及 2100 Bionanalyzer QC。 | ||
螢光標定後進行晶片實驗:RNA 雜交反應,Wash 晶片後進行晶片掃描。 | ||
Microarray 影像分析及 data 輸出。 |
晶片原始影像、RNA QC 報告、原始訊號數值、miRNA Array 表現標準參考說明及統計分析,並由專員做資料詳盡解說。
報告內容 | 報告產出 | 說明 | 格式 |
---|---|---|---|
圖檔部份 | Scanning image | Combined Cy3, Cy5 image | TIFF |
數值部份 | Raw data | 原始訊號數值 | Excel |
Normalized ratio ( 經 75th percentile 方法進行 normalization ) | 統計分析 | Excel |