蛋白質體分析 Proteome Analysis

SomaScan 使用獨特的化學修飾適體 ( 單股 DNA 短序列 ) - SOMAmer ( 慢解離速率修飾適體 ) 作為蛋白質親和試劑，相較於傳統的抗體分析具有更高的穩定性與再現性。透過具有獨特疏水性官能基修飾的 DNA 與聚陰離子競爭劑，與特定蛋白質產生強烈的特異性吸附；用以蛋白質體分析的 SOMAmer，有獨特的 Fluorophore-Linker-Biotin 的設計 ( 圖一 )，後續可進行螢光偵測，對應原始樣本中的蛋白質含量。

【圖一】SOMAmer 的結構

SomaScan assay，使用 SOMAmer 進行蛋白質體分析，步驟如下所示：

	SOMAmer 藉由 Biotin 固定於載體上，加入檢體後，捕捉特定目標蛋白質。
	紫外光照射將 SOMAmer - 蛋白質複合體釋放，非特異性結合的蛋白質易與 SOMAmer 解離，使用 Polyanionic competitors 阻止非特異性蛋白再次結合。
	將特異結合的 SOMAmer - 蛋白質複合體進一步清洗後，未結合蛋白質的 SOMAmer 被洗去，檢體中蛋白質量正比於其對應結合的 SOMAmer 量。
	將 SOMAmer 沖出並純化，和製有 SOMAmer 互補序列的 DNA 探針晶片反應，以偵測每一種 SOMAmer 的量，並推算得對應蛋白質含量。

Learn How The SomaScan® Assay Works

SomaScan Assay - 現提供 11K 與 7K 兩種蛋白質分析方案

SomaScan 11K Assay		SomaScan 7K Assay
11,000 total protein measurements including 10,000 unique human proteins measured Sample size: 55 µL		7,000 total protein measurements including 6,700 unique human proteins measured Sample size: 55 µL
Recommended for new studies to get the greatest coverage of the proteome		Recommended for continuation of existing projects, use in a broader range of sample types, and access to specialized proteomic panels and tests
Sample types: Human and non-human plasma and serum		Sample types: Human and non-human serum and plasma, tissue, cerebrospinal fluid (CSF), urine, and more

SomaLogic 的蛋白質體分析技術，欲深入了解，請見 SomaLogic 官方網站。

檢體需求

	檢體類型及儲放條件	注意
標準檢體類型	人類血漿、血清、尿液	其他檢體類型請洽威健
血漿、血清適用抗凝劑	EDTA, citrate, CTAD, heparin 皆可	EDTA 為佳；將血液於室溫下離心 2200 x g (not RPM) 15分鐘，取液體層
血漿、血清提供體積	55uL x 2 管， 管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
尿液 (限7K)	260uL x 2 管， 管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
儲存溫度	-80°C

服務產品

SomaScan 7K 與 11K ( 蛋白質一覽表 )

SomaScan 發表文獻，歡迎至 SomaLogic 連結查詢。

• 偵測再現性高，針對血液與血漿檢體 CV 低至 5%
• 非特異性作用解離快，Polyanionic competitors 阻止非特異性結合
• 僅需 55μL 樣本，Dynamic Range 範圍從 fM-μM，達 10 log
• 穩定地檢測稀有的蛋白質，無須樣品預處理
• 可提供達 11,000 種總蛋白質測量結果