|
|
RESEQUENCING
Resequencing NGS Service
對於已知序列物種之全基因體進行定序，第一步就是將這些定序完成的短片段與參考序列進行比對，透過軟體找出變異 (Variants) 與其改變之型態 (SNPs or InDels)，便可知道其改變是否會造成胺基酸變化；藉由 NGS 技術可快速了解基因型 (Genotype) 與表現型 (Phenotype) 之間的關連性為何，對於人類或動植物等方面之研究將更為直接而快速。
實驗流程
樣品條件
| DNA QC 標準： | |||
|---|---|---|---|
| Sample Type | Genomic DNA (RNase Treat & Dissolved in Nuclease-free Water) | ||
| Amount | ≧ 5 μg | ||
| Concentration | ≧ 50 ng/μl | ||
| OD260/280 | 1.8-2.0 | OD260/230 | ≧ 1.8 |
| Ration of gDNA Conc. | Qubit / NanoDrop ≧ 0.7 | ||
定序策略
- Illumina Solexa Platform
- Paired-End / 30X 以上的定序量
威健在生物高通量實驗技術服務有相當專業且豐富的經驗。面對 NGS 熱潮，我們皆以客戶需求為優先考量，依照客戶預算與研究需要，經全盤評估後建議最佳定序量或實驗方式。專業而靈活的服務，每個步驟的用心都值得您信賴！
分析流程及內容
Standard Analysis - 標準分析服務
- Data Cleaning：去除 Quality 較差之數據確保後續分析的正確性。
- Alignment：clean data 與參考序列進行比對。
- Variants Calling：找出與參考序列之差異。
- Variants Annotation：預測每個核苷酸變異對胺基酸改變之影響。
Advanced Analysis - 進階分析服務 (加選)
- Consensus Sequence：單一共同序列輸出。
- Copy Number Variation：基因拷貝數變異分析。
- Structure Variation：基因組結構變異分析。
- 其他客製化分析。
回到頂端
代理品牌
